相傳，在大西洋的深海處，有一個神秘而古老的亞特蘭提斯王國。
這裏居住着的生物，竟是安徒生童話裏的美人魚。
一次偶然的機會，「校園三劍客」與美人魚有了意想不到的交集：受「神秘客」的委託，「校園三劍客」要前往A國完成一樁秘密的海洋探索，尋找亞特蘭提斯王國。
沒想到，他們剛一踏入A國境內，就遇見一條被抓捕的美人魚。
為了營救美人魚，「校園三劍客」秘密潛入了一處軍事基地，竟發現科學家正拿美人魚做奇怪的實驗。
在與軍方人員一番鬥智鬥勇後，「校園三劍客」終於成功救出美人魚，幫助她重返海洋。
A國軍隊為什麼要捕捉美人魚？他們在美人魚身上要做什麼實驗？
「校園三劍客」接下去的海洋探險，又將與美人魚展開怎樣的奇遇？
亞特蘭提斯王國到底隱藏着怎樣的神秘故事？